MacMolPlt for Mac

Sự miêu tả

MacMolPlt là một công cụ trực quan hóa Hóa học có thể được sử dụng để xây dựng các phân tử bằng trình tạo mô hình đồ họa tích hợp, tạo các tệp đầu vào cho chương trình hóa học tính toán GAMESS và sau đó trực quan hóa kết quả của các lần chạy hóa học tính toán. Các tính năng bao gồm màn hình 3D chất lượng cao, hoạt ảnh của các chế độ bình thường và chuỗi phản ứng và xuất ra nhiều định dạng bao gồm hình ảnh chất lượng cao và phim QuickTime và Flash.

Nhập liệu bằng cách sử dụng: Định dạng tệp MolPlt được GAMESS đục lỗ bằng cách dán theo tọa độ Descartes từ bất kỳ tệp nhật ký GAMESS hoặc Gaussian nào bất kỳ tệp nhập GAMESS, tệp nhật ký hoặc tệp irc tệp Xmol kiểu XYZ nào Tệp định dạng MolDen Tệp Ngân hàng Dữ liệu Protein (pdb) Tệp Ngôn ngữ Đánh dấu Hóa học (CML) tệp Xây dựng bằng đồ họa với trình chỉnh sửa phân tử tương tác Xây dựng bằng tay bằng cách sử dụng tọa độ bên trong kiểu ma trận Cartesian hoặc Z-Matrix Hiển thị 3D của cấu trúc và chế độ Bình thường Hoạt ảnh của chế độ Bình thường. Xoay và dịch thời gian thực 3D dưới sự điều khiển của chuột Tính toán bất kỳ tham số ma trận Z nào Đo lường/hiển thị trực quan khoảng cách, góc và hình nhị diện. Tự động tạo đường dẫn Chuyển động tuyến tính thấp nhất (LLM) Tính toán và hiển thị 2D và 3D và hiển thị: Các obitan phân tử (AO's, MO hoặc LMO) Sự khác biệt về mật độ điện tử tổng cộng Sự khác biệt về mật độ điện tử phân tử (MEPMaps) Trình tạo tệp đầu vào cơ bản cho GAMESS OpenGL được sử dụng cho cao- kết xuất 3D chất lượng Hỗ trợ đối xứng phân tử Tạo ra các nguyên tử phụ thuộc đối xứng Xác định các nguyên tử duy nhất đối xứng Tự động xác định danh sách các nhóm điểm được hỗ trợ cho một tập hợp các tọa độ. Xoay tọa độ theo hướng nguyên lý thích hợp Hiển thị toán tử đối xứng cho nhiều nhóm điểm Đầu ra chất lượng xuất bản (màu hoặc đen trắng) thông qua in trực tiếp hoặc Sao chép và Dán vào Ứng dụng khác. Đầu ra ở nhiều dạng bao gồm Windows bitmap, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, Flash Movies và QuickTime.