GATE

Sự miêu tả

GATE (Phân tích lưới của biểu thức chuỗi thời gian) là một nền tảng phần mềm tính toán tích hợp để phân tích và trực quan hóa chuỗi thời gian phân tử sinh học chiều cao. GATE sử dụng thuật toán phân nhóm dựa trên tương quan để sắp xếp chuỗi thời gian phân tử trên một mảng lục giác hai chiều và tự động tô màu các hình lục giác riêng lẻ theo mức độ biểu hiện của thành phần phân tử mà chúng được chỉ định, để tạo phim hoạt hình phân tử cấp hệ thống. động lực điều tiết. Để suy ra các cơ chế kiểm soát quy định tiềm năng từ các mẫu tương quan, GATE cũng cho phép thẩm vấn tương tác phim dựa trên nhiều bộ dữ liệu kiến ​​thức trước đây. Phim GATE có thể bị tạm dừng và có tính tương tác, cho phép người dùng xây dựng lại mạng và thực hiện các phân tích làm giàu chức năng. Phim được tạo bằng GATE có thể được lưu ở định dạng Flash và chèn trực tiếp vào tệp bản thảo PDF dưới dạng các hình tương tác.