MultiGeneBlast

Sự miêu tả

MultiGeneBlast là một công cụ mã nguồn mở dựa trên việc định dạng lại các tiêu đề FASTA của các mục protein NCBI GenBank, sử dụng công cụ này có thể theo dõi tọa độ và nucleotide nguồn của chúng. MultiGeneBlast có thể hỗ trợ phát hiện các phần đa gen như vậy cho các dự án sinh học tổng hợp. Một thư viện tổng hợp của các operon có thể được tạo dựa trên đầu ra của nó để xác định các operon có chức năng gần nhất với chức năng mà người dùng mong muốn. Công cụ này cung cấp cơ hội xác định tất cả các vùng gen tương đồng bằng cách kết hợp kết quả của các lần chạy BlastP đơn lẻ trên mỗi gen và phân loại các vùng gen từ bất kỳ mục nhập GenBank nào theo số lần truy cập, bảo tồn tổng hợp và điểm số bit Blast tích lũy. Tìm kiếm kiến ​​trúc có thể được thực hiện để tìm bất kỳ vùng gen nào có số lần truy cập Blast cho bất kỳ sự kết hợp trình tự axit amin nào do người dùng chỉ định.