GenoSuite

Sự miêu tả

GenoSuite là một khung được phát triển để phân tích hệ sinh học protein. Chiến lược dựa trên FDRScore được sử dụng để tích hợp kết quả từ nhiều thuật toán tìm kiếm. Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) được phát triển như một phần của khung GenoSuite. PPT dành cho việc tìm kiếm các bản dịch mới trong bộ gen của sinh vật nhân sơ và phụ thuộc vào dữ liệu proteomics dựa trên Phép đo phổ khối và trình tự bộ gen liên quan. Các tính năng bao gồm được định cấu hình cho 4 thuật toán nguồn mở để thực hiện tìm kiếm cơ sở dữ liệu để xác định peptit và bất kỳ kết hợp nào của 4 thuật toán có thể được chọn, liệt kê ra các peptit cụ thể tìm kiếm bộ gen (peptit mới), các kết quả phù hợp phổ có thể được hiển thị để đánh giá chất lượng, liệt kê các protein mới và những thay đổi trong các chú thích protein hiện có, và bối cảnh bộ gen trực quan của các peptit mới cũng có thể được tạo ra.